V súčasnosti
nie je na Zanzibare
povinné žiadne očkovanie. Odporúča sa však očkovanie proti vírusovej hepatitíde A a tiež proti brušnému týfusu. Krajina leží v stredne malarickej oblasti, preto sa odporúča aj antimalarická profylaxia a používanie účinných repelentov.
Ak prichádzate do krajiny z oblasti s výskytom žltej zimnice, môže sa od vás pri vstupe vyžadovať predloženie medzinárodného očkovacieho preukazu so záznamom o očkovaní proti tejto chorobe.